中國醫學科學院醫學信息研究所/圖書館是國家級醫學信息研究中心、醫學信息資源保障與服務中心、衛生政策與管理研究中心、醫學與健康政策發展研究中心，承擔國家醫學圖書館、醫學信息與情報研究、衛生政策研究等方面的重要任務，同時承擔著國家科技圖書文獻中心（NSTL）醫學分中心、國家人口與健康科學數據共享平臺工程技術中心、世界衛生組織（WHO）衛生與生物醫學信息合作中心、國家新型農村合作醫療異地就醫結算管理中心相關職能和任務，是為國家醫藥衛生事業改革發展和醫學科技創新提供信息服務和決策咨詢的重要支撐機構。